职于新宿区政府的宫古新，本应成为一个普通的公务员，却被调遣到了一个东京23区各区都无人知晓的“夜间地域交流科”任务。 任务的内容是，处置各种妖怪们惹起的超自然事情。 与部门的晚辈即课长榊京一，和狂热喜好超自然现象的姬冢圣央一同，每日与逾越人类知识的存在相处，日日夜夜出勤任务。
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